चार विभिन्न प्रोटीनों के लिए रामचंद्रन आलेख नीचे  दिए गए हैं।

प्रोटीनों के सही युग्म का चयन कीजिए जो प्रकृति में मुख्यतः अल्फा कुंडलित हैं।

सही उत्तर C और D है

अवधारणा:

• पेप्टाइड बंध एमाइड बंधन है जो तब बनता है जब एक एमिनो एसिड के α-एमिनो एसिड का अयुग्मित इलेक्ट्रॉन युग्म दूसरे एमिनो एसिड के कार्बोक्सिल कार्बन पर आक्रमण करता है।
• यह एक नाभिक स्नेही एसाइल प्रतिस्थापन अभिक्रिया है, जिसमें जल का एक अणु उप-उत्पाद के रूप में मुक्त होता है।
• पेप्टाइड बंध में 40% आंशिक द्विबंध गुण होते हैं, जिसके कारण 6-परमाणु अणु कठोर समतलीय विन्यास में होते हैं और पेप्टाइड बंध का घूर्णन प्रतिबंधित होता है।
• पेप्टाइड बंध का घूर्णन कोण ω द्वारा दिया जाता है और इसका मान आमतौर पर 180°(ट्रांस) होता है और कभी-कभी इसका मान \(\psi\) = 0° होता है।

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• हालाँकि \(\ N - C\alpha\) और \(C\alpha - C\) बंधों के साथ घूर्णन की अनुमति है।
• \(\ N - C\alpha\) अनुदिश घूर्णन को ϕ कहा जाता है जबकि \(C\alpha - C\) अनुदिश घूर्णन को \(\psi\) कहा जाता है।
• \(\psi\) और ϕ का मान +180° से -180° तक हो सकता है, लेकिन अधिकांश मान पॉलीपेप्टाइड की रीढ़ की हड्डी और अमीनो एसिड की साइड चेन में परमाणुओं के बीच स्थैतिक बाधा के कारण निषिद्ध हैं।
• जी. एन. रामचंद्रन, अनुमत मान निर्धारित करने वाले पहले व्यक्ति थे और यह अनुमत मान ϕ- \(\psi\) समतल में दर्शाया गया है और इसे रामचंद्रन कहा जाता है

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• रामचंद्रन आरेख में, सफेद क्षेत्र सख्ती से निषिद्ध संरूपण के क्षेत्र से मेल खाता है, यह क्षेत्र ग्लाइसीन को छोड़कर अमीनो एसिड के लिए सख्ती से निषिद्ध है।
• अप्रकाशित क्षेत्र उन क्षेत्रों से मेल खाता है जहां कोई स्थैतिक हस्तक्षेप नहीं होता है, इसलिए यह अनुमत क्षेत्र है।
• रेखांकित क्षेत्र वैन डेर वाल्स दूरी की बाहरी सीमा वाले संरूपण से मेल खाता है, अर्थात, यह परमाणुओं को एक दूसरे के करीब आने की अनुमति देता है।
• रामचंद्रन सिद्धांत कहता है कि सबसे अधिक संभावित पुष्टि अल्फा हेलिक्स, बीटा स्ट्रैंड और पॉलीपेप्टाइड श्रृंखलाओं में मोड़ हैं क्योंकि परमाणुओं के बीच स्थैतिक टकराव के कारण अधिकांश अन्य संरचनाएं असंभव हैं।

स्पष्टीकरण:

• प्लॉट A: बीटा-शीट क्षेत्र में एक बड़ा  समूह दिखाता है। यह प्रोटीन मुख्य रूप से बीटा-शीट है।
• प्लॉट बी: बीटा-शीट क्षेत्र में एक समूह भी दिखाता है, जो दर्शाता है कि यह प्रोटीन भी मुख्य रूप से बीटा-शीट है।
• प्लॉट सी: अल्फा-हेलीकल क्षेत्र (लगभग Φ = -60° और Ψ = -45°) में एक सघन समूह दर्शाता है, जो दर्शाता है कि यह प्रोटीन मुख्य रूप से अल्फा-हेलीकल है।
• प्लॉट डी: अल्फा-हेलिकल क्षेत्र में एक समूह भी दिखाता है, जो दर्शाता है कि यह प्रोटीन भी मुख्य रूप से अल्फा-हेलिकल है।

निष्कर्ष:

• C और D दोनों में रामचंद्रन प्लॉट अल्फा-हेलीकल संरचना का संकेत देते हैं, जिससे विकल्प 4 सही उत्तर बन जाता है।